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Protein spielt eine Rolle im TGF-beta-Weg
Das Protein LTBP1 ist in hohen Konzentrationen bei pulmonaler arterieller Hypertonie
(PAH) aktiv und könnte ein diagnostischer Marker und therapeutisches Ziel bei der Krankheit sein, wie eine neue Studie zeigt.
„Unsere Studie legt nahe, dass LTBP1 an der Entwicklung von PAH beteiligt ist und als potenzielles diagnostisches und therapeutisches Ziel für PAH dient“, schrieben die Forscher in „
Bioinformatische Analyse der Eigenschaften der Immunzellinfiltration und Korrelation mit entscheidenden diagnostischen Markern bei pulmonaler arterieller Hypertonie“
. “, das in
BMC Pulmonary Medicine
veröffentlicht wurde .Es wird angenommen, dass Entzündungen eine entscheidende Rolle bei der Schädigung von Lunge und Blutgefäßen bei PAH spielen. Die molekularen Details, die sie verursachen, sind jedoch nicht vollständig geklärt, was Wissenschaftler in China dazu veranlasste, Entzündungsmarker zu identifizieren, die bei der Erkennung von PAH helfen oder als Angriffspunkte für deren Behandlung dienen könnten .Sie erhielten Daten aus mehreren Datensätzen menschlicher Lungenproben von Menschen mit oder ohne PAH und testeten sie dann auf unterschiedlich exprimierte Gene, wobei die Gene mit PAH deutlich mehr oder weniger aktiv waren als ohne.
Höhere, niedrigere Werte bestimmter Zellen bei PAHDie Analyse identifizierte 223 Gene, die bei PAH überaktiv waren, und weitere 196 Gene, die weniger aktiv waren. Viele dieser Gene sind an molekularen Signalwegen beteiligt, die bei PAH eine Rolle spielen, beispielsweise am TGF-beta-Signalweg.
Die Unterschiede in der Genaktivität der beteiligten Immunzelltypen ließen darauf schließen, dass Menschen mit PAH höhere Konzentrationen bestimmter Immunzelltypen aufwiesen, darunter mehrere Untergruppen von T-Zellen und ruhenden Mastzellen (ein Typ von Immunzellen, der bei allergischen Reaktionen eine herausragende Rolle spielt). Sie wiesen auch geringere Mengen anderer Immunzelltypen auf, darunter aktivierte Mastzellen, Monozyten und Neutrophile.Die Wissenschaftler analysierten die unterschiedlich exprimierten Gene anhand ihrer Funktionalität und suchten nach sogenannten „Hub-Genen“, die mit vielen anderen fehlregulierten Genen interagieren. Sie identifizierten vier Hub-Gene –
LTBP1, das bei PAH in hohen Mengen exprimiert wurde, und
CR1 ,
TXNRD1 und
TLR1 – alle bei PAH in geringen Mengen exprimiert.
Um zu testen, wie gut diese Hub-Gene PAH identifizieren können, berechneten die Forscher eine statistische Metrik namens Fläche unter der Receiver Operating Characteristic Curve (AUC). Hierbei wird getestet, wie gut ein bestimmter Parameter zwischen zwei Gruppen unterscheiden kann (z. B. PAH oder nicht). Die AUC-Werte liegen zwischen 0,5 und 1, wobei höhere Werte auf eine bessere Differenzierungsfähigkeit hinweisen.Für alle vier Hub-Gene lag die AUC in den analysierten Datensätzen über 0,9. Die höchste AUC von 0,968 wurde für
LTBP1 beobachtet , das bei PAH in höheren Konzentrationen exprimiert wird. Dieses Gen liefert Anweisungen zur Herstellung eines Proteins, auch LTBP1 genannt, das eine Rolle im TGF-beta-Signalweg spielt.Die Forscher zeigten, dass die Aktivität
des LTBP1- Gens mit den Spiegeln einiger Immunzellen in den menschlichen Datensätzen korreliert. Weitere Experimente in einem PAH-Rattenmodell zeigten, dass das LTBP1-Protein in der Lunge und den Lungenarterien in erhöhten Konzentrationen aktiv war.
„LTBP1 ist hochreguliert und korreliert mit der Infiltration von Immunzellen bei PAH, was als neuer kritischer Biomarker für PAH identifiziert wurde“, sagten die Forscher und fügten hinzu, dass weitere Forschung erforderlich sei, um die Rolle dieses Proteins bei PAH zu untersuchen.